从成本方面来看，根据《中国氢能源及燃料电池产业白皮书（2019 年）》，综合考虑设备折旧、运维和公用工程消耗后，副产氢气纯化作为燃料电池原料氢气的纯化成本约为 0.3~0.6 元 /kg，再将副产气体成本计入，则制氢成本为 10~16 元 /kg[22]。化石能源制氢价格最为低廉，工艺最为成熟，但其制备过程碳排放高。
电解水制氢的氢气品质最好，但成本也是最高的。根据万联证券 19 年 10 月发布的关于制氢终极方案的研究报告中提到，参考平均原料价格比较不同制氢工艺下的制氢成本：
* 煤制氢成本为 9 -11 元 / 公斤，是当前国内成本最低的制氢路线（煤炭价格为 550 元 / 吨时）；
* 天然气制氢成本为 20-24 元（天然气价格为 3.5 元 / 立方米时）；
* 甲醇制氢成本为 23 元 -25 元 / 公斤（甲醇价格为 3000 元 / 吨时）；
* 电解水制氢成本为 40 元-50 元 / 公斤（电力价格为 0.6 元 /kWh 时）。
* 工业副产氢平均成本为 12 元 -18 元 / 公斤。
